Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms