Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms