Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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