Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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