Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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