Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms