Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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