Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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