Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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TIMMDC1Q9NPL8 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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TIMMDC1Q9NPL8 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TIMMDC1Q9NPL8 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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