Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms