Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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