Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SMCO1Q147U7 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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