Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL4A6Q14031 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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COL4A6Q14031 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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