Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms