Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ITGB3BPQ13352 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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