Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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