Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC048383.1-201ENST00000558226 527 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 HMGB4-203ENST00000519684 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TMEM108-203ENST00000508711 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 FMOD-201ENST00000354955 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CDY4P-201ENST00000418290 1513 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC000068.3-201ENST00000607934 427 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC9□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms