Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 FCRL4-201ENST00000271532 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 CD36-209ENST00000435819 2365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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