Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms