Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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