Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PHACTR1Q9C0D0 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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