Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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