Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C8orf49Q96NF6 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms