Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF337-201ENST00000252979 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SLN-201ENST00000305991 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SPRR2D-204ENST00000368758 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PRSS37-203ENST00000438520 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL513542.1-201ENST00000452494 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LHFPL3-AS2-201ENST00000453666 923 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC083906.3-201ENST00000509201 466 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC131025.1-201ENST00000521756 588 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-7-201ENST00000522952 271 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CD3E-204ENST00000528600 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ARHGDIB-207ENST00000541644 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP003721.3-201ENST00000543275 405 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP001005.2-201ENST00000575066 763 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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ANKRD39Q53RE8 ZFP14-202ENST00000589280 642 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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ANKRD39Q53RE8 AL121830.1-203ENST00000598694 701 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL138966.1-201ENST00000603212 313 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P67-201ENST00000604027 926 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.211-201ENST00000635920 276 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PAQR5-205ENST00000561153 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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