Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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