Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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