Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SIX1Q15475 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SIX1Q15475 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SIX1Q15475 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SIX1Q15475 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SIX1Q15475 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SIX1Q15475 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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SIX1Q15475 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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