Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms