Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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PTCH1Q13635 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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