Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTCH1Q13635 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms