Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms