Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SEMA3BQ13214 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SEMA3BQ13214 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
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