Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TSPAN31Q12999 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms