Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms