Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC113554.2-201ENST00000577647 4862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CD44-201ENST00000263398 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 YOD1-201ENST00000315927 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CES2-201ENST00000317091 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 LSMEM1-201ENST00000312849 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 TCTN3-201ENST00000265993 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 KCNA2-215ENST00000640956 1584 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 RABL2A-201ENST00000376439 623 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 GPR55-202ENST00000392040 3828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 PRYP1-201ENST00000412474 445 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 PRYP2-201ENST00000416652 492 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 HLA-T-206ENST00000429813 450 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RPS28P8-201ENST00000435020 208 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL080317.1-201ENST00000444259 557 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL109613.1-205ENST00000446684 714 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 MEF2C-203ENST00000437473 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DMRTC1B-201ENST00000334036 1197 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AF096876.1-201ENST00000565564 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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HOXD11P31277 NAPA-AS1-202ENST00000594367 630 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 ZNF799-204ENST00000595766 576 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 DMRTC1-202ENST00000596389 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 RN7SL796P-201ENST00000613991 291 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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