Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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HOXD10P28358 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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