Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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