Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PHACTR1Q9C0D0 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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