Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms