Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PDK4Q16654 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PDK4Q16654 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PDK4Q16654 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PDK4Q16654 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PDK4Q16654 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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