Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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