Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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