Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
RAB39AQ14964 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms