Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SP140Q13342 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SP140Q13342 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
SP140Q13342 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SP140Q13342 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms