Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 STAT4-201ENST00000358470 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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