Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms