Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms