Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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TRIM35Q9UPQ4 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TRIM35Q9UPQ4 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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