Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
EHD3Q9NZN3 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms