Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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FOXQ1Q9C009 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXQ1Q9C009 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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