Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CAVIN4Q5BKX8 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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